פורסם 2003 במאי 2222 שנים שלום,אני יגדיר עכשיו את ההבעיה שיש לי ומקווה שמישהו יוכל לעזור. יש להזכיר שלא צריך לכתוב את הפונקציות שבונות suffix tree, הן כבר נתונות לפי האלגוריתם של אוקנון. מה שצריך זה אלגוריתם (לא תוכנית מחשב) יעיל, מהיר ולא בזבזן במקום.הגדרה:תת מחרוזת נקראת MUM אם:1. היא מופיע בכל אחת ממחרוזות הקלט.2. היא מופיע בכל אחת מהן בדיוק פעם אחת.3. אין תת מחרוזת אחרת המכילה אותה ומקיימת את תכונה 1+2.הבעיה: בהינתן קבוצת גנומים ( מחרוזות תווים ארוכות מאוד שהא"ב שלהם מוגבל בדר"כ ל-4 אותיות), צריך למצוא את הMUMים תוך שימוש בsuffix tree.דוגמה:ababcABCDddCRTYYEddABCDfdabcCRTYYEeabcabCRTYYEABCDrtyyydabc ה-MUMים כאן הם:1. ABCD2. CRTYYE(סימנתי אן באותיות גדולות את הMUM, אבל במחרוזות המקוריות הכל מופיע באותיות קטנות).מקווה שמישהו הבין את הבעיה.תודה מראש,אליeliahninyo@hotmail.com
פורסם 2003 ביוני 1222 שנים http://www.csse.monash.edu.au/~lloyd/tildeAlgDS/Tree/Suffix/הנה הסבר על SUFFIX TREE... אין לי כוח לעבור על זה... אני את הקורסים שלי באלגוריתמים כבר עשיתי....אתה לומד ביואינפורמטיקה במקרה
ארכיון
דיון זה הועבר לארכיון ולא ניתן להוסיף בו תגובות חדשות.